Formaty danych wykorzystywanych w oprogramowaniu DEPHOS można podzielić na następujące typy:

•Pliki projektu DEPHOS

•Pliki rysunkowe

•Pliki rastrowe

•Pliki chmur punktów

•Plik georeferencyjny

•Plik głębokości

•Pliki siatki typu GRID

•Plik definicji płaszczyzny

•Plik definicji UCS

•Plik punktów osnowy

•Plik macierzy transformacji

•Plik raportu obliczenia transformacji

•Pliki palety kolorów

•Plik TERRA

•Plik raport wyrównania

•Pliki wymiany z systemem AeroSYS

•Plik biblioteki kamer

•Plik SIDEBAR

•Plik HOTKEYS

•Plik TRI ANG

•Pliki TOOLBAR

•Plik wysokościowej definicji kolorów

•Plik definicji pól

•Plik biblioteki symboli

•Plik wektorów

•Plik LUT

•Plik kursora CUD

•Pliki pasków narzędzi

•Plik ustawień myszy 3D

•Plik błędów DTM